大足石刻文物医院的建设理念是将文物保护修复的工作，类比为医学学科，创建一个包括文物分析检测（医学检验）、文物预防性保护（保健医学）、文物保护修复处理（临床医学）、文物保护档案及数字化（医学档案管理）、文物保护管理与成果展示、公众研学和互动体验等核心功能的文物保护工作流程，并借鉴参考医院的架构，将这一流程运用到大足石刻文物保护机构的功能单元设置与实现过程中，从而实现传统文物修复技术与现代科学技术有机的融合。主要建设内容包括：1.文物病害诊断分析室；2.文物保护技术研究室；3.文物保护修复室；4.文物保护材料与药品存储室；5.专用器材设备室；6.文物保护科技档案室；7.保护与修复成果展示室、体验室；8.大足石刻监测预警中心；9.配套的设备用房、管理办公用房及服务用房。大足石刻文物医院将主要围绕南方石窟寺基础理论与方法研究、关键技术攻关、工程示范应用、创新平台建设四个层面，不断深化石窟寺保护领域多学科联合交叉，有效促进科技成果的高效转化，全面提升石窟寺文物保护领域科学技术水平，逐步打破文物修复向来“养在深闺人未识”的格局，让公众能够更深层次地了解文物修复的过程，有力推动重庆作为西部中心城市在文物科技保护领域的影响力。